El estudiante de instituto Setsuna Mudô sufre por un amor prohibido: está enamorado de su propia hermana Sara. Un día, Setsuna descubre que él es la reencarnación de Alexiel, un ángel que fue condenado por haberse rebelado contra Dios durante la gran guerra entre las fuerzas del Cielo y del Infierno. Justo entonces, Rosiel, el hermano mellizo de Alexiel, resurge gracias a un plan llamado "Santuario de Ángeles". Distintos personajes, como el demonio Kurai, el misterioso Kira y ángeles de alta jerarquía, se cruzarán en el destino de Setsuna, mientras las garras de Rosiel se ciernen sobre él y su hermana... Comienza la espectacular batalla de los ángeles caídos.